没有经过修改的文章，见刊的可能几乎十分的小。投稿之前的SCI文章，需要作者一遍一遍的修改确认，或是合作者的参与修改。而投稿后的SCI文章，也常常会收到编辑大修、小修的各类修改意见。总之，一篇SCI总是在改改改中度过。但是，如何在每次修改中让文章得到提升呢？
作者的自我修改
SCI论文修改中，研究的主要承担者通常在实验和调查数据的整理分析过程中开始转告。在转告过程中，自身作者和通讯作者(通常是研究团队的负责人)一般也会参与。大多在资料分析完成之后不久，可以形成初稿。
一篇SCI论文的初稿完成后，撰稿人在投稿之前必须静下心来检查和修改SCI论文的内容、文体和格式，其目的是提高SCI论文质量和避免犯一些不必要的错误。一篇高质量SCI论文往往要经过多次自我修改，即使是经验丰富的作者，也难以一次定稿。
首先，在写作初稿时，不能过于拘泥细节，这样容易产生“只见树木，不见森林”的现象。重点应放在SCI论文的重要数据、主要思想、主要方法、结果的解释以及文章的整体结构上。
其次，在写作初稿时，作者有可能会处于“当局者迷”的状态。如果将初稿放一段时间再检查，这时作者就可能会转入“旁观者清”的状态，从而能看出初稿中的错误。与初稿保持距离有助于发现错误，比如说在不同地点、不同时间、不同文件格式(两倍行距而不是一倍行距)来阅读SCI论文有助于找出错误。
第三，是对论文的材料进行再次的整合与修改。去粗取精、去伪存真。对引用的材料进行整合，使其能够简练准确地支持论文的观点。对不能支持文章的观点要大刀阔斧的进行删除，否则就会造成论文的冗长。对于证据不足的文章，要重新去寻找充分的证明材料。对于引用的数据和名言之类的一定要保证其真实性。
最后，是关于语病的问题。由于一般论文的学术性很强，在语言的表达上面需要表达准确，同时要保证语句没有语病。如果论文投的是外文期刊的话，需要对翻译的句子进行修正，最起码要符合外语的表达习惯，不要出现语法的错误和单词拼写的错误。
合作者的参与修改
现代科学研究往往很复杂，通常需要多名作者参加。初稿形成后，应该讲SCI论文的初稿送给各位合作者阅读。因为每名合作者的教育背景和工作经验均有所不同，他们可以从各自的角度来阅读SCI论文，发现撰稿人未能发现的问题，包括对分析的方法、结果的解释、SCI论文的表达方式等提出建设性的修改意见;有些合作者甚至可以直接帮助修改SCI论文，提高SCI论文的质量。
期刊编辑看外审后的大修小修
1)小修后接受：这个决定也称作有条件接受，表示论文需要进行一些细微的修改后就能被期刊接受，小修后接受的论文可能不需要再次经历审稿，一般期刊编辑会自己检查后做出裁决，不过，作者还是要记得“小修后发表”不保证一定会接受，还是要让编辑对你的修改满意才行。
2)大修后接受：当编辑认为论文需要大幅度的修改就会做出这个决定，作者在返还修改稿的时候需要附上给审稿意见的逐点回复，修稿后的论文也可能再送外审，通常会交给第一轮的审稿人，但，当然，编辑也有权选择不同的审稿人，第二轮的审稿，有些期刊称作“再审稿”，结果如何是根据作者针对评审和编辑意见进行的修改还有回复来决定，如果作者没有完整回复所有的意见，那就有可能再有修改，甚至有可能会拒稿。
无论是大修还是小修，我们可以通过以下的步骤来进行文章的修改：
第一步是关于文章的结构，我们要调整文章的结构，结构的条理要清楚，但是要尊重文章的原有结构，否则可能越改越乱。
第二步是关于文章的数据，要保证数据的准确性和真实性，对那些表述模糊的数据和案例要进行适当的删减，如果数据不充分的话，需要寻找相关的数据进行补充。对于SCI论文而言，在论文数据中实验数据更是一个重要的内容，那么对实验数据应该如何处理呢?
1.做实验前，尤其是新实验(哪怕是实验室其他人已经做了N遍的实验)先尽可能的写清楚实验步骤(protocol)， 这个protocol最好用英文写，并且做成电子版，存在自己的电脑中，打印一份贴在自己的笔记本中，以后再用该protocol， 只需写明：参见xx页(refer Pxx。这样到时候写论文时，就很方便了;
2.新的实验结果一旦得到，要将数据尽快整理成图表，用Powerpoint做成PPT格式，质量和格式就和准备发表一样，哪怕是阴性结果，并且将实验的相关信息和参数尽量详细列出，这样以后无论是开会做presentation还是撰写论文都会方便很多;
3.如果是阴性结果，和预测的不同，分析问题的可能原因，有无别的替代方法?是否要修改原来实验方案乃至整个实验设计?;
4.同样重要的是，在实验过程中，要经常(我一般一周至少一次)查Pubmed(生物医学最着名的、最重要的摘要数据库)， 看相关领域是否有新的论文发表，如果相同思路的结果已经发表，就要及时调整实验方向。
第三步是对论文的材料进行再次的整合与修改。去粗取精、去伪存真。对引用的材料进行整合，使其能够简练准确地支持论文的观点。对不能支持文章的观点要大刀阔斧的进行删除，否则就会造成论文的冗长。对于证据不足的文章，要重新去寻找充分的证明材料。对于引用的数据和名言之类的一定要保证其真实性。
第四步是关于语病的问题。由于一般论文的学术性很强，在语言的表达上面需要表达准确，同时要保证语句没有语病。如果论文投的是外文期刊的话，需要对翻译的句子进行修正，最起码要符合外语的表达习惯，不要出现语法的错误和单词拼写的错误。审稿人一般会对我们的论文提出意见，但是不管怎样我们都不能改变论文原本的中心论点。在整体的表达上面，表达的脉络要清晰，语句上要表达通顺，论点清晰，论据充足。
